MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pAW63

Total Repeats: 1728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020240	T	6	6	43	48	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020240	TCT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020240	CTT	2	6	87	92	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020240	TTC	2	6	108	113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020240	TCT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020240	TTA	2	6	136	141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020240	TCT	3	9	154	162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020240	TTC	2	6	203	208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020240	CTTT	2	8	308	315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020240	AAT	2	6	443	448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020240	TTTGG	2	10	470	479	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020240	CAT	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020240	TCCTA	2	10	609	618	20 %	40 %	0 %	40 %	449086378
14	NC_020240	CCTT	2	8	640	647	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
15	NC_020240	CAT	2	6	662	667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086378
16	NC_020240	ATC	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086378
17	NC_020240	AAG	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086378
18	NC_020240	TGT	2	6	725	730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086378
19	NC_020240	GA	3	6	788	793	50 %	0 %	50 %	0 %	449086378
20	NC_020240	CAG	2	6	818	823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086378
21	NC_020240	CTT	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086378
22	NC_020240	TTC	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086378
23	NC_020240	TTAA	2	8	907	914	50 %	50 %	0 %	0 %	449086378
24	NC_020240	TGT	2	6	925	930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086378
25	NC_020240	CTT	2	6	965	970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086378
26	NC_020240	CAT	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086378
27	NC_020240	TC	3	6	1006	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
28	NC_020240	ACA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086378
29	NC_020240	CTTC	2	8	1055	1062	0 %	50 %	0 %	50 %	449086378
30	NC_020240	CTT	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086379
31	NC_020240	TA	3	6	1214	1219	50 %	50 %	0 %	0 %	449086379
32	NC_020240	ATTT	2	8	1228	1235	25 %	75 %	0 %	0 %	449086379
33	NC_020240	TCA	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086379
34	NC_020240	TA	3	6	1412	1417	50 %	50 %	0 %	0 %	449086379
35	NC_020240	TAA	2	6	1436	1441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086379
36	NC_020240	TTC	2	6	1496	1501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020240	A	6	6	1532	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020240	TTC	2	6	1611	1616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020240	CTC	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020240	T	6	6	1659	1664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020240	T	7	7	1736	1742	0 %	100 %	0 %	0 %	449086380
42	NC_020240	AAT	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086380
43	NC_020240	TTTTC	2	10	1763	1772	0 %	80 %	0 %	20 %	449086380
44	NC_020240	TCT	2	6	1786	1791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086380
45	NC_020240	TGA	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086380
46	NC_020240	TAG	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086380
47	NC_020240	ATC	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086380
48	NC_020240	TCT	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086380
49	NC_020240	TTTCT	2	10	1976	1985	0 %	80 %	0 %	20 %	449086380
50	NC_020240	TGT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086380
51	NC_020240	ACGT	2	8	2080	2087	25 %	25 %	25 %	25 %	449086380
52	NC_020240	ATC	2	6	2109	2114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086380
53	NC_020240	AT	3	6	2140	2145	50 %	50 %	0 %	0 %	449086380
54	NC_020240	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086380
55	NC_020240	TAT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086380
56	NC_020240	TATT	2	8	2269	2276	25 %	75 %	0 %	0 %	449086380
57	NC_020240	TTGA	2	8	2352	2359	25 %	50 %	25 %	0 %	449086380
58	NC_020240	T	6	6	2373	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	449086380
59	NC_020240	GGA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449086380
60	NC_020240	TTC	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086380
61	NC_020240	A	6	6	2484	2489	100 %	0 %	0 %	0 %	449086380
62	NC_020240	TAAA	2	8	2513	2520	75 %	25 %	0 %	0 %	449086380
63	NC_020240	CCTT	2	8	2525	2532	0 %	50 %	0 %	50 %	449086380
64	NC_020240	CCTT	2	8	2554	2561	0 %	50 %	0 %	50 %	449086380
65	NC_020240	ATTC	2	8	2562	2569	25 %	50 %	0 %	25 %	449086380
66	NC_020240	AAAATT	2	12	2571	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086380
67	NC_020240	TGT	2	6	2588	2593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086381
68	NC_020240	TAC	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086381
69	NC_020240	TTTC	2	8	2659	2666	0 %	75 %	0 %	25 %	449086381
70	NC_020240	CTT	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086381
71	NC_020240	T	6	6	2781	2786	0 %	100 %	0 %	0 %	449086381
72	NC_020240	TACC	2	8	2805	2812	25 %	25 %	0 %	50 %	449086381
73	NC_020240	ATG	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086381
74	NC_020240	TCCT	2	8	2866	2873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020240	ATTT	2	8	2879	2886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020240	TAGT	2	8	2908	2915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020240	CAT	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020240	TCT	2	6	2989	2994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086382
79	NC_020240	ACA	2	6	3019	3024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086382
80	NC_020240	GTT	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086382
81	NC_020240	T	7	7	3038	3044	0 %	100 %	0 %	0 %	449086382
82	NC_020240	CTA	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086382
83	NC_020240	CTA	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086382
84	NC_020240	GTT	2	6	3228	3233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086382
85	NC_020240	TC	3	6	3237	3242	0 %	50 %	0 %	50 %	449086382
86	NC_020240	TTTGT	2	10	3306	3315	0 %	80 %	20 %	0 %	449086382
87	NC_020240	CTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	449086382
88	NC_020240	T	6	6	3339	3344	0 %	100 %	0 %	0 %	449086382
89	NC_020240	T	6	6	3372	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	449086382
90	NC_020240	TCTT	2	8	3454	3461	0 %	75 %	0 %	25 %	449086382
91	NC_020240	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086382
92	NC_020240	ATTT	2	8	3553	3560	25 %	75 %	0 %	0 %	449086382
93	NC_020240	T	6	6	3574	3579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020240	GTT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020240	ATG	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020240	TGAC	2	8	3702	3709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020240	GAA	2	6	3737	3742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020240	TGC	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020240	GAA	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020240	CATA	2	8	3897	3904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020240	CATC	2	8	3931	3938	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020240	TTA	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020240	ATA	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020240	ACC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_020240	TTG	2	6	4090	4095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020240	ACC	2	6	4109	4114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_020240	CAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020240	AAT	3	9	4138	4146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020240	CAT	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020240	GTA	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020240	T	6	6	4460	4465	0 %	100 %	0 %	0 %	449086383
112	NC_020240	GTTT	2	8	4549	4556	0 %	75 %	25 %	0 %	449086383
113	NC_020240	ATGA	2	8	4590	4597	50 %	25 %	25 %	0 %	449086383
114	NC_020240	GTG	2	6	4647	4652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449086383
115	NC_020240	TAG	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086383
116	NC_020240	ATTT	2	8	4802	4809	25 %	75 %	0 %	0 %	449086383
117	NC_020240	ATT	2	6	4944	4949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086383
118	NC_020240	ATTG	2	8	4980	4987	25 %	50 %	25 %	0 %	449086383
119	NC_020240	TTTCA	2	10	5055	5064	20 %	60 %	0 %	20 %	449086383
120	NC_020240	TA	3	6	5120	5125	50 %	50 %	0 %	0 %	449086383
121	NC_020240	TGA	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086383
122	NC_020240	CTT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086383
123	NC_020240	TAC	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086383
124	NC_020240	ATA	2	6	5258	5263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086383
125	NC_020240	T	6	6	5287	5292	0 %	100 %	0 %	0 %	449086383
126	NC_020240	ATT	2	6	5302	5307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086383
127	NC_020240	ATC	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086383
128	NC_020240	ATT	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086383
129	NC_020240	ATG	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086383
130	NC_020240	T	6	6	5605	5610	0 %	100 %	0 %	0 %	449086383
131	NC_020240	TG	3	6	5712	5717	0 %	50 %	50 %	0 %	449086383
132	NC_020240	TATATC	2	12	5742	5753	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	449086383
133	NC_020240	TTG	2	6	5895	5900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086383
134	NC_020240	TTG	2	6	5918	5923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086383
135	NC_020240	CT	3	6	5969	5974	0 %	50 %	0 %	50 %	449086383
136	NC_020240	GTT	2	6	6002	6007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086383
137	NC_020240	TATC	2	8	6053	6060	25 %	50 %	0 %	25 %	449086383
138	NC_020240	AGA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086383
139	NC_020240	ATTT	2	8	6170	6177	25 %	75 %	0 %	0 %	449086383
140	NC_020240	TTC	2	6	6186	6191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086383
141	NC_020240	TTG	2	6	6242	6247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086383
142	NC_020240	CCT	2	6	6264	6269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_020240	AAAC	2	8	6329	6336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020240	AGT	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020240	T	6	6	6470	6475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020240	AT	3	6	6491	6496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020240	TG	3	6	6616	6621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020240	CTA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020240	CATG	2	8	6809	6816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020240	GTT	2	6	6833	6838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020240	AT	3	6	6874	6879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020240	TTG	2	6	6886	6891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020240	ATA	2	6	6968	6973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020240	CT	3	6	7001	7006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_020240	ATA	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020240	CCA	2	6	7071	7076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_020240	GGT	2	6	7100	7105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020240	CCA	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_020240	ATT	2	6	7217	7222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020240	ACC	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_020240	ACC	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086384
162	NC_020240	ACTT	2	8	7388	7395	25 %	50 %	0 %	25 %	449086384
163	NC_020240	GTG	2	6	7573	7578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449086384
164	NC_020240	A	6	6	7607	7612	100 %	0 %	0 %	0 %	449086384
165	NC_020240	TCA	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086384
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167	NC_020240	TCTCT	2	10	7753	7762	0 %	60 %	0 %	40 %	449086384
168	NC_020240	GAC	2	6	7777	7782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086384
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170	NC_020240	TCC	2	6	7956	7961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449086384
171	NC_020240	TCT	2	6	8049	8054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086384
172	NC_020240	AGG	2	6	8072	8077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449086384
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175	NC_020240	TCA	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086384
176	NC_020240	TTG	2	6	8281	8286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086384
177	NC_020240	CTT	2	6	8323	8328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086384
178	NC_020240	ATT	2	6	8355	8360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086384
179	NC_020240	TGC	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449086384
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183	NC_020240	A	7	7	8530	8536	100 %	0 %	0 %	0 %	449086384
184	NC_020240	AAAT	2	8	8545	8552	75 %	25 %	0 %	0 %	449086384
185	NC_020240	TGA	3	9	8607	8615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086384
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187	NC_020240	CTT	2	6	8719	8724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086384
188	NC_020240	TTTC	2	8	8770	8777	0 %	75 %	0 %	25 %	449086384
189	NC_020240	GTT	2	6	8803	8808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086384
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232	NC_020240	TAT	2	6	10648	10653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086387
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248	NC_020240	TC	3	6	11277	11282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
249	NC_020240	T	6	6	11285	11290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_020240	TTG	2	6	11297	11302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_020240	GA	3	6	11317	11322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
252	NC_020240	AGAAA	2	10	11333	11342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020240	AAC	2	6	11401	11406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_020240	TAT	3	9	11425	11433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_020240	TTC	2	6	11478	11483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_020240	T	7	7	11484	11490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020240	CCT	2	6	11519	11524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_020240	TTCT	2	8	11594	11601	0 %	75 %	0 %	25 %	449086388
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265	NC_020240	TC	3	6	11950	11955	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
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271	NC_020240	TGT	2	6	12123	12128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086388
272	NC_020240	GTT	2	6	12174	12179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086388
273	NC_020240	TTG	2	6	12203	12208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086388
274	NC_020240	ATT	2	6	12255	12260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086388
275	NC_020240	TGC	2	6	12288	12293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449086388
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277	NC_020240	TC	3	6	12355	12360	0 %	50 %	0 %	50 %	449086388
278	NC_020240	ATTG	2	8	12393	12400	25 %	50 %	25 %	0 %	449086388
279	NC_020240	ATTT	2	8	12515	12522	25 %	75 %	0 %	0 %	449086388
280	NC_020240	CTG	2	6	12542	12547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449086388
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296	NC_020240	CTG	2	6	12902	12907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449086388
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351	NC_020240	TTG	2	6	15187	15192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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353	NC_020240	AAG	2	6	15239	15244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
354	NC_020240	TGTA	2	8	15274	15281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_020240	TCCC	2	8	17509	17516	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
398	NC_020240	CA	3	6	17700	17705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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402	NC_020240	CCT	2	6	17856	17861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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404	NC_020240	ATCA	2	8	17912	17919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
405	NC_020240	CTGTAT	2	12	17980	17991	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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412	NC_020240	GTA	2	6	18338	18343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
413	NC_020240	GAA	2	6	18393	18398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
414	NC_020240	T	6	6	18410	18415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_020240	TTCTT	2	10	18426	18435	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
416	NC_020240	ATG	2	6	18467	18472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
417	NC_020240	TTA	2	6	18524	18529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_020240	T	7	7	20491	20497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020240	A	6	6	21578	21583	100 %	0 %	0 %	0 %	449086392

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